Sa formule chimique générale est complexe et peut varier, mais elle est souvent donnée comme : (Ca,Na)19(Al,Mg,Fe)13(SiO4)10(Si2O7)4(OH,F,O)10
Elle contient donc principalement du calcium (Ca), de l'aluminium (Al) et du silicium (Si), avec des quantités variables de magnésium (Mg), de fer (Fe), de sodium (Na), et parfois des traces de bore (B), de fluor (F) et d'autres éléments.
La complexité de sa composition chimique explique la grande variété de ses couleurs et de ses propriétés.
L'idocrase cristallise dans le système tétragonal.
Son groupe d'espace est généralement P4/nnc.
Les cristaux se présentent souvent sous forme de prismes courts à longs, terminés par des pyramides tronquées, et peuvent être morphologiquement complexes avec de nombreuses faces. On la trouve également sous des formes columnaires, granulaires ou massives.
Des macles fines peuvent être observées à une échelle microscopique.
Dureté : 6 à 7 sur l'échelle de Mohs.
Densité : Varie de 3.32 à 3.47 g/cm³.
Clivage : Indistinct à mauvais sur les plans {110}, {100} et très mauvais sur {001}.
Fracture : Irrégulière à subconchoïdale.
Ténacité : Fragile.
Éclat : Vitreux à résineux.
Couleur : Très variable, incluant le vert (souvent des nuances de vert olive à vert émeraude), le brun, le jaune, l'incolore à blanc, le bleu (variété cyprine, due à la présence de cuivre), le violet, le rose, le rouge et le noir. Les cristaux peuvent souvent présenter des zonations de couleur.
Trait : Blanc.
Transparence : Transparent à translucide, parfois opaque (surtout pour les variétés massives comme la californite).
L'idocrase se forme typiquement dans les roches carbonatées qui ont subi un métamorphisme de contact ou hydrothermal.
On la trouve couramment dans les skarns (roches métamorphiques riches en silicates de calcium et de magnésium), les calcaires métamorphisés, les dolomies, les serpentinites et parfois dans les veines alpines ou les roches ignées alcalines.
Elle est souvent associée à d'autres minéraux tels que le grenat grossulaire, le diopside, la wollastonite, l'épidote, la scapolite, le spinelle et la calcite.